基于GEO数据库对脑梗死相关差异基因的分析研究
【摘要】 目的比较模型组（MCAO组）大鼠与假手术组（Sham组）大鼠脑组织的差异基因，分析差异基因影响的功能通路，为脑梗死的治疗提供可行的研究方向和具体的作用靶点。方法在GEO数据库下载MCAO组大鼠与Sham组大鼠脑组织中的表达谱芯片，并通过R软件得到差异基因；利用DAVID6.8分析差异基因的GO功能富集和KEGG通路富集。结果通过分析得到148个差异表达基因，123条GO富集通路，主要涉及药物反应、脂多糖反应、炎症反应、有机环状化合物反应及细胞外基质等生物过程，并与蛋白结合、受体结合、蛋白质同源化活性、整合素结合、蛋白酶结合及趋化因子的活性等分子功能相关；KEGG通路富集分析，得到显著性富集通路23条，涉及TNF信号通路、NF-κB信号通路、Toll样受体信号通路和HIF-1信号通路等。结论TNF信号通路与NF-κB信号通路可能是治疗脑梗死的行之有效的干预方向。
