骨质疏松症miRNA和基因差异表达分析及miRNA-mRNA调控网络的构建
【摘要】 目的miRNA在骨质疏松症的发生发展过程中发挥重要作用ꎮ文中旨在筛选与骨质疏松症密切相关的miR~NA和基因ꎬ完成骨质疏松症miRNA~mRNA调控网络的构建ꎮ方法通过GEO数据库查找骨质疏松症的基因芯片表达谱ꎬ采用GEO2R进行分析并筛选差异表达基因(DEGs)和差异表达miRNAꎬ采用火山图对差异基因和miRNA进行展示ꎬ然后通过David在线数据库完成GO和KEGG通路分析ꎬString在线数据库用于完成PPI蛋白网络分析ꎮ采用TargetScan、miRTarBase和miRDB预测靶基因ꎬ最后通过Cytoscape软件进行PPI和miRNA~mRNA调控网络可视化ꎮ结果通过筛选得到15个差异miRNA和174个差异表达基因ꎮ通过GO和KEGG通路分析得到25条GO功能注释ꎬ生物过程包括对药物的反应、血管生成、离子迁移、GTPase介导的信号转导的调控、适应性免疫反应等ꎬKEGG富集分析得到NF~κB信号通路、HIF~1信号通路和谷胱甘肽
