基于TCGA全基因组RNA测序数据集探索结肠腺癌发病机制的研究
【摘要】 目的通过对癌症基因组图谱(测序数据集进行富集分析(GSEA)数据库中结肠腺癌(),探索结肠腺癌发病的相关机制。方法从COADTCGA集。以患者癌组织和癌旁正常结肠组织作为分组变量,以“)患者癌组织和癌旁正常结肠组织的全基因组TCGA数据库下载COAD相关的RNA”和“RNA测序数据”作为c2.cp.kegg.v6.2.symbols.gmtc5.all.v6.2.symbols.gmtP和错误发现率()的富集结果为差异有版进行分析,以、GSEA2-2.2.3|NES|>1Norminal-<0.05FDR<0.25的分析结果显示患者的癌组织和癌旁正常结肠组织全基因组表达差异与细胞周期、复COAD参照基因集,使用统计学意义。结果COAD制与修复、脂质代谢和离子转运等生物学功能相关;GSEAGO患者癌和癌旁正常结肠组织全基因组表达差异与信号通路、趋化因子信号通路和自噬的调节等代谢通路有关。结论本研究从全基因组层面在转录富集结果显示KEGGCOADDNA细胞周期、复