结肠癌和直肠癌患者肠道菌群构成差异分析
【摘要】 目的分析结肠癌与直肠癌患者肠道菌群的构成差异。方法收集2018年7月至2019年1月于哈尔滨医科大学附属第二医院就诊的72例大肠癌患者粪便样本，将其分为结肠癌组和直肠癌组，均为36例。提取粪便样本DNA，并对其进行高通量测序。采用生物信息学方法分析两组患者肠道菌群多样性及菌群构成的差异，探讨差异菌群可能的促癌机制。结果72例样本经过高通量测序，共获得原始序列2356560条，优质序列32730条，样本序列平均长度主要集中在401~460bp，对所有序列进行操作分类单元(0Tu)物种分类学注释后，获得1409个0Tu。Alpha多样性分析结果提示，直肠癌组和结肠癌组shannon指数分别为2.61±o.56和2.43±0.67，差异无统计学意义(f=1.229，P=0.223);Simpson指数分别为o.17±o.09和o.21±0.16，差异无统计学意义(f=1.449，P=o.151)。组间差异分析和线性判别分析(LDA)显示:在门水平，厚壁菌门(Firmicutes)在直肠癌患者肠道中丰度更高(LDA值为4.67，P=0.014)，变形菌门(Prote
