3种粪便标本保存方法对肠道菌群检测结果影响的比较研究
【摘要】 比较3种粪便标本保存方法对肠道菌群检测结果的影响，为采集粪便标本后短期保存方法的选择提供参考。收集10名志愿者的新鲜粪便标本，对每份标本分别采用4℃、室温(25℃)、无水乙醇保存4h，然后统一放入-80℃低温冰箱冻存。随后进行细菌DNA提取，并对16SrRNAV4区基因进行扩增，应用IlluminaMiSeq平台进行高通量测序，比较3种保存方法下肠道菌群多样性和组成差异。结果表明，3种保存方法下，肠道菌群在Alpha多样性方面无统计学差异(P>0.05)。肠道菌群属水平比较，毛螺旋菌属(Lachnospira)在无水乙醇组中相对丰度高于4℃组和室温组(P<0.05)，萨特菌属(Sutterella)在无水乙醇组中相对丰度高于4℃组(P<0.05)，而真杆菌属(Eubacterium)在无水乙醇组中相对丰度低于室温组(P<0.05)。PCoA分析发现，当UniFrac距离加权后，4℃和无水乙醇保存同一受试者粪便标本，菌群结果较为接近，而室温保存
