禽腺病毒血清4型贵州株全基因序列分析
【摘要】 为了解禽腺病毒血清4型(FAdV-4)地方流行毒株的分子进化情况,基于实验室分离的2株FAdV-4贵州株GZ-BJ株和GZ-QL株,分别对2株FAdV-4毒株进行PCR分段扩增,扩增产物克隆至载体,提取质粒进行PCR和双酶切鉴定后筛选出重组质粒进行测序,将测序结果依次拼接得到病毒的全基因组,获得FAdV-4贵州株的全基因序列,并对其进行序列和遗传进化分析°结果显示,通过PCR分段扩增成功获得了2株FAdV-4贵州株(GZ-BJ株和GZ-QL株)的全基因序列,长度分别为43352、43723bp,FAdV-4GZ-BJ株全基因序列长度比FAdV-4GZ-QL株短371bp,少6个ORF(22K、putative9.1ku、u-exon、ORF17、ORF28、ORF42),二者的氨基酸同源性为57.1%°2株FAdV-4贵州株同国内外不同地区FAdV-4毒株核昔酸同源性在887%〜100%,与FAdV-4经典毒株ON1比对!株FAdV-4贵州株和国内FAdV-4分离株均缺失ORF19、ORF27、ORF30。系统进化树分析显