环状RNA circRTN4IP1在肝细胞癌中的生物信息学分析及其与预后的关系
【摘要】 目的探讨环状RNAcircRTN4IP1在肝细胞癌（HCC）中的表达及其与预后的关系。方法使用R软件的Limma包分析GEO数据集GSE97332、GSE94508、GSE78520，联合筛选差异表达的环状RNA。通过CSCD网站预测circRTN4IP1结合的microRNA（miRNA），使用TargetScan、miRDB、miRTarBase数据库联合预测miRNA的靶基因，并对其进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。应用STRING在线工具分析靶基因的功能和蛋白质相互作用（PPI）网络，筛选关键基因。采用Kaplan-MeierPlotter数据库分析其与预后的关系。收集2016年8月至2018年6月于中山大学孙逸仙纪念医院行手术切除的60例HCC患者癌组织及配对癌旁组织，荧光定量RT-PCR检测组织circRTN4IP1表达水平，并分析其与HCC患者临床病理特征和预后的关系。两组circRTN4IP1mRNA相对表
