84K杨4CL34CL5基因克隆及生物信息学分析
【摘要】 木质素是木材的重要组成成分，主要起机械支持、水分运输及防御病虫害等作用。4CL酶是控制木质素合成途径中的关键酶之一。利用PCR技术从84K杨幼叶cDNA中克隆得到Pag4CL3/4CL5基因，GenBank登录号分别为MK183O33(Pag4CL3)及MK183034(Pag4CL5)利用生物信息学软件，对这两个基因的功能和特征进行分析。结果发现84K杨中4CL3/4CL5蛋白与毛果杨中4CL3/4CL5蛋白相似度高达97%;此外,均含有SSGTTGLP-KGV和GEICIRG两个保守基序;亚细胞定位预测显示Pag4CL3/4CL5蛋白主要定位在内质网中，推测可能是一种膜蛋白;蛋白的亲水性预测Pag4CL3/4CL5均为亲水性蛋白。通过qRT-PCR分析Pag4CL3&4CL5在不同组织部位中的表达差异，结果发现Pag4CL3在叶及茎中表达量较高，在根和顶芽中表达量较低;Pag4CL5在叶及根中表达量较高，在茎和顶芽中表达量较低，两个同源基因表达具有组织部位的差异性。P"g4CL3和P"g4CL5可能在叶中共同行使功能,Pag4CL5主要在根中行使功
