食管鳞癌组织中差异表达miR-17-92基因簇成员及其靶基因的筛选、生物学功能分析
【摘要】 目的筛选食管鳞癌（ESCC）组织中差异表达的miR-17-92基因簇及其靶基因，分析靶基因的生物学功能，并探讨miR-17-92基因簇及其靶基因与患者临床病理特征、预后的关系。方法下载癌症基因组图谱（TCGA）数据库和基因表达综合（GEO）数据库（GSE43732数据集）中ESCC相关数据，分别采用edgeR包和GEO2R分析miR-17-92基因簇的表达情况。将ESCC组织、正常食管组织及癌旁组织中差异表达最显著（差异倍数>2倍，校正后P<0.05）的miR-17-92基因簇成员作为关键miRNAs。采用miRDB6.0、TargetScan7.2及miRTarBase8.0在线网站预测关键miRNAs的靶基因，经蛋白互作网络分析及差异表达分析确定关键靶基因。对关键靶基因进行KEGG信号通路和GO功能富集分析。采用独立样本t检验或Mann-WhitneyU检验分析关键miRNAs及其关键靶基因与ESCC临床病理学特征间的关系，采用生存分析评价关键miRNAs及其关键靶基因与ESCC患者预后的关系。结果相对于正常食管组织及癌旁组织，ESCC组织中miR-17-92基因簇表达均上调，其中
