基于计算机文本挖掘的白内障氧化应激相关基因功能富集及药物治疗分析
【摘要】 目的利用计算机工具和已知的数据库进行挖掘和分析进而确定与白内障和抗欁ogyHospitalofChinaMedicalUniver欁sity,theKeyLaboratoryofLensinLia氧化应激相关的基因集及信号通路,并进行白内障可能的有效治疗药物的预测和探索。方法利用文本挖掘工具pubmed2ensembl对白内障和抗氧化应激均相关的基因进行初步oningProvince,Shenyang110005,Li欁筛选,得到的基因集利用GeneCodis工具进行基因功能的富集分析和京都基因与基因组百aoningProvince,China欁Responsibleauthor:YANQiChang,科全书(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes,KEGG)通路分析,富集的结果则应用欁Email:cmu4hyqc@126.com;ORSTRING工具进行进一步蛋白质蛋白质相互作用分析,选取相互作用紧密的基因,最后使欁CID:0000000324080861欁用DGIdb工具得到基因