胶质瘤差异表达基因筛选、功能富集和相关信号通路生物信息学分析

【摘要】 目的采用生物信息分析技术探讨胶质瘤()差异表达基因筛选、功能富集和相关信号通路。方法在基因表达谱数据库()中选取胶质瘤中相关基因表达谱芯片数据,采用R包筛选胶质瘤患者肿瘤组织和正常脑组织中差异表达基因。对筛选出的差异表达基因进行GEO软件lima功能富集(和GOKEGG),应用采用蛋白⁃蛋白相互作用数据库()分析筛选出的差异表达基因编码蛋白间的相互作用关系,分析相关信号通路。结果选取据集为分析对象,筛选出差异表达超过倍,且P<0.05)为整合素结合、细胞黏附分子结合、钙离子结合及2(MF于细胞膜、神经元细胞体及神经细胞轴突等,而其生物学过程(AMPASTRING和基因表达谱数的基因GSE15824个。GSE66354个差异基因主要分子功能158谷氨酸受体活性等;细胞组分定位(158)CC)主要为细胞黏附、神经系统发育、BP细胞增殖、酶活性、细胞凋亡和血管生成等;信号通路主要为信号通路、嘌呤代谢通GTP信号通路及信号通路,KEGGcAMP个差异表达基因蛋白相互作用网络中相互作用连