桑树桑黄菌丝体和子实体基因差异表达分析
【摘要】 通过对桑树桑黄Sanghuangporussanghuang菌丝体和子实体2个不同生长阶段的转录组进行分析，为研究桑黄子实体生长发育相关机制奠定基础。采用Illumina测序技术，对桑树桑黄菌株S23菌丝体和子实体2个不同生长发育阶段进行了全转录组测序。将转录组测序reads比对到参考序列上，菌丝体测序样本的reads比对率为82.89%；子实体测序样本的reads比对率为83%。基因差异表达分析显示，与菌丝体相比，子实体中显著上调表达基因为2898个，显著下调表达基因为1965个。经过Blastnr比对发现，桑黄菌在子实体阶段表达量上升的基因主要与各种氧化酶活性、疏水蛋白等相关；表达量下降的基因主要与糖类、氨基酸结合、运输等相关。基因本体（geneontology，GO）富集分析表明，菌丝体及子实体两个阶段与跨膜转运相关的差异表达基因富集明显。代谢通路（pathway）富集分析表明，类固醇生物合成、精氨酸生物合成、丝裂原活化蛋白激酶（mitogen-activatedproteinkinase，MAPK）信号通路等差异基因富集明显。
