慢性房颤心房肌细胞成分结构的基因本体法分析
【摘要】 目的应用基因本体法研究慢性房颤心房肌细胞成分分子病理异常。方法选择接受二尖瓣置换术的二尖瓣狭窄为主的48例风湿性心脏病患者,其中慢性房颤24例(慢性房颤组)、窦性心律24例(窦性心律组)。取两组右心耳心肌,采用Westernblotting法检测钙调蛋白(CaM)表达,应用全基因组表达谱芯片检测技术,获取数据行主成分、系统聚类及细胞组件基因本体分析。结果慢性房颤组、窦性心律组心房肌组织中CaM相对表达量分别为0.199±0.058、0.135±0.034,两组相比P<0.05。主成分分析显示,慢性房颤组和窦性心律组心房肌样本在二维空间上明确分布于不同的区域;系统聚类将所有样本聚为慢性房颤和窦性心律两类;DIVID系统在线分析显示,慢性房颤和窦性心律差异表达基因在细胞成分本体有肌原纤维、细胞外基质、胶原三聚体等37个注释条目异常;注释条目富集聚类显示,心房肌结构受房颤影响依次为细胞外成分、收缩纤维及细胞骨架等。结论慢性房颤与窦性心律心房肌基因表达模式明显不同,慢性房颤心房肌细胞外结构、收缩纤维