鸡骨草与毛鸡骨草的比较转录组学分析

【摘要】 目的比较鸡骨草和毛鸡骨草转录组信息,获得两者比较转录组学的差异。方法利用TM高通量测序平台对鸡骨草和毛鸡骨草嫩叶样品进行转录组测序;将基因序列与蛋白库作HiSeq对,通过预测编码蛋白框获得编码蛋白和蛋白序列;使用4000和软件联用法找出物种间的特有基blastpOrthoMCL因和同源基因,开展特有基因和富集分析、单拷贝同源基因分析。结果鸡骨草和毛鸡骨草分别检测出、1807317189KEGG个特有基因,同源基因有GO个。特有基因富集分析发现,鸡骨草的核糖体途KEGG径富集基因数量最多且差异最显著,毛鸡骨草中转运蛋白和胞吞作用途径等显著性富集,植物病原互作Illumina比blastx在两个物种间都呈现显著性富集;富集分析中发现,鸡骨草的胞吞作用调节、囊泡介导的转运调节、核糖体等显著富集,毛鸡骨草中的微管结合复合物、细胞骨架、细胞膜和蛋白磷酸化作用呈现显著性富集。近缘物37881ABCGO种比对分析结果显示鸡骨草和毛鸡骨草的物种亲缘关系极为