甲状腺乳头状癌中异常甲基化基因筛查

【摘要】 背景与目的:DNA甲基化是一种重要表观遗传学改变,在肿瘤的发病、诊断、预后评估乃至治疗上都具有重要的临床意义。甲状腺癌是临床最常见的内分泌系统恶性肿瘤,目前国内外对甲状腺癌中DNA甲基化研究相对较少。筛查在甲状腺乳头状癌中存在异常甲基化的基因。方法:收集2014年1月-2014年6月在复旦大学附属肿瘤医院头颈外科行甲状腺癌根治手术的患者的甲状腺乳头状癌组织及癌旁的正常甲状腺组织88对。通过前期高通量甲基化DNA亲和纯化测序技术(Methylcap-Seq)初步建立甲状腺乳头状癌全基因组甲基化谱式。通过生物信息学手段及甲基化特异性PCR技术(methylationspecificPCR,MSP)进行初筛和复筛。结果:通过生物信息学手段分析初步选取46个基因位点进行检测,最终发现HOXD10和FOXD2基因启动子区存在异常高甲基化改变。HOXD10基因在甲状腺癌组织中44.4%呈高甲基化,而在癌旁组织中仅20.5%(P<0.001);FOXD2基因在甲状腺癌组织中54.5%呈高甲基化,而在癌旁组织中仅38.6%(P<0.001)。其与甲状腺癌患者临床病理因素的多因素分析