喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNACytb遗传多样性及系统发育分析

【摘要】 牦牛是喀喇昆仑-帕米尔地区重要的畜种资源,而关于该区域牦牛遗传多样性和系统进化的研究鲜有报道。对喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛mtDNACytb基因进行遗传多样性分析,结果表明:mtDNACytb基因全长为1140bp,其中T、C、A和G碱基的平均含量分别为26.2%、29.0%、31.7%、13.1%,其中A+T碱基含量(57.9%)大于C+G碱基的含量(42.1%),存在碱基的偏倚性;共检测出10个多态位点,5个单倍型,变异类型仅有转换;检测的平均单倍型多样性0.599±0.00123,平均核苷酸差异性3.363,平均核苷酸多样性0.00259。基于国内牦牛群体构建系统发育树表明:喀喇昆仑-帕米尔地区牦牛与野牦牛亲缘关系较近,与巴州牦牛亲缘关系较远;利用GenBank已提交的牦牛和牛亚科代表物种序列,选用最大似然法构建系统发育树,结果表明牦牛与美洲野牛亲缘关系较近,与普通牛亲缘关系较远。