乳腺转移性癌的体细胞突变基因相关研究

【摘要】 目的利用公共数据库大数据,筛选乳腺癌原发性癌灶和转移癌灶2类癌组织之间具有明显差异突变的基因群,并探索其显著富集的功能及通路。方法从公共数据库下载乳腺癌全基因组测序数据,行统计学分析,对突变基因群进行GO功能和KEGG通路富集分析。最后将转移癌灶部位分3个亚组进行分析,分析不同转移部位的共性和个性差异突变基因和显著富集GO功能、KEGG通路。结果共发现211个具有显著差异的体细胞突变基因,包括ESR1,UBE3A,KIT等,对其进行GO和KEGG富集分析显示,这些显著性差异体细胞突变基因可能与如对类固醇激素的反应、细胞生长调节、MAPK信号通路、乳腺癌信号通路、cAMP信号通路等功能及通路相关。乳腺癌不同部位转移癌灶之间个性的差异突变基因和显著富集GO功能、KEGG通路较多,共性的较少。结论乳腺癌转移癌灶相比于原发灶具有独特的差异突变基因群、显著富集GO功能和KEGG通路,不同部位转移灶之间差异突变基因群、显著富集GO功能和KEGG通路差异较大。