鼠伤寒沙门菌小RNAGcvB靶基因的预测与验证
【摘要】 为筛选鼠伤寒沙门菌小RNAGcvB调控的靶基因，本研究通过TartRNA2软件预测能与GcvBR1、R2ge和R3区产生作用的基因，将鼠伤寒沙门菌gcvB基因敲除株的转录组测序结果注释到KEGG数据库以及GO富集分析，并利用荧光定量PCR对预测的靶基因进行验证。TartRNA2的预测结果显示，杂交能量最高的narY、getrpB和STM2732基因均能够和小RNAGcvB产生至少7个连续的碱基互补，narY、rpB基因分别yeaK、yeaK和t与鼠伤寒沙门菌无氧呼吸、脯氨酸与tRNA的识别以及色氨酸的合成相关。荧光定量PCR检测结果显示，narY、trpB和STM2732基因在gcvB基因敲除条件下转录水平分别上调3.4、9.8、12.1和18.37倍。以上结果表yeaK、、明，和基因受小的负调控且可能为直接负调控。本研究为进一步探明小narY、eaKtrBSTM2732RNAGcvBypRNAGcvB与靶基因相互作用、小RNA的调控机制以及沙门菌致病机制奠定了基础。
