基于microRNA测序分析miRNA在刺葡萄抗白腐病中的作用
【摘要】 目的]在前期的种质资源评价过程中，发掘一株中国野生刺葡萄0943，该株系高抗葡萄白腐病。基于mi-croRNA（miRNA）在植物抗病中的重要作用，拟从miRNA水平探讨刺葡萄在受到病原菌侵染后的表达调控机制。[方法]以抗病的中国野生刺葡萄为试材，对比感病的欧亚种`美人指`，分别以病原菌诱导，在0hpi（hourspostinoculation）和病菌诱导后的12hpi、36hpi处理后采样，进行二代测序，并对数据进行KEGG及表达量的差异分析。[结果]对比感病葡萄`美人指`，分析了抗病刺葡萄在基础代谢和抗病途径中的差异，结合miRNA的表达量，获得了150个表达量发生变化的miRNA，其中44个miRNA的表达在刺葡萄和`美人指`之间存在差异。5个miRNA在刺葡萄中特异表达，但是在`美人指`中不表达，实施定量验证了这一结果。靶基因预测显示，其靶基因包括与抗病的紧密相关的WRKY、SPL、EFR等转录因子，还包括与抗病直接相关的LRR类的抗病基因。[结论]筛选出5个在刺葡萄上特异表达候选miRNA
