水稻幼穗响应盐胁迫的转录组分析

【摘要】 盐胁迫是影响作物生长发育的重要环境因素之一。鉴定水稻耐盐新基因以及揭示其可能的机制并应用于新种质创制和新品种选育,是提高水稻耐盐性的重要途径之一。本研究以实验室自主选育的耐盐性不同的水稻品系58M和58L为材料,用0.6%NaCl处理0、6、24h后收集水稻的幼穗,并进行转录组测序研究。结果发现,以0h的幼穗为对照,58M品系在盐胁迫6h后检测到表达上调基因1483个,下调基因1085个;盐胁迫24h后上调基因937个,下调基因459个。58L品系在盐胁迫6h后有931个基因上调,2614个下调基因;盐胁迫24h后有930个基因上调,1299个下调基因。通过韦恩图分析发现,盐胁迫6h后有178个基因在58M品系中上调,在58L中下调;盐胁迫24h后有30个基因在58M品系中上调,在58L中下调。将这208个目标基因进行GO功能富集分析与KEGGpathway分析,GO分析发现,这些差异基因在生物学过程、细胞组分和分子功能3个主类中,分别占4