拟环纹豹蛛响应温度胁迫SNP位点挖掘及其功能注释分析
【摘要】 单核苷酸多态性(SNP)是基因组中普遍存在的遗传变异，是一种重要的遗传标记。为了解拟环纹豹蛛转录组中响应温度胁迫的SNP候选位点及SNP所在基因SNP-Unigenes的功能注释，主要采用SOAPsnp软件对拟环纹豹蛛在不同温度胁迫条件下的转录组测序结果进行SNP检测，并把SNP所在基因SNP-Unigenes比对到GO、COG、KEGG数据库，获得SNP-Unigenes的注释及参与的功能情况。结果表明:拟环纹豹蛛转录组SNP位点分布在7421条SNP-Unigenes上，共存在402910个SNP位点，SNP发生频率为1/301bp;功能注释分类揭示拟环纹豹蛛在低温胁迫和高温胁迫条件下，SNP-Unigenes主要参与蛋白质转运、核糖体代谢、氧化磷酸化和氨基酸代谢功能，从而补偿热应力下蛋白质的损伤，加快拟环纹豹蛛对温度变化的适应。综上，筛选到拟环纹豹蛛响应温度胁迫相关的SNP位点或SNP-Unigenes，为将来深入研究拟环纹豹蛛响应温度胁迫的分子机制提供基础数据。
