17β-雌二醇注射雌性金钱鱼下丘脑转录组分析

【摘要】 目的]通过转录组测序分析雌激素(17β-Estradiol,E2)对雌性金钱鱼下丘脑中基因表达的影响。[方法]E2体注射后进行雌性金钱鱼下丘脑转录组测序,基因功能注释,差异基因筛选、鉴定,GO(GeneOntologyannotation)和KEGG(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes)信号通路富集分析,并利用实时定量PCR(Real-timequantitativePCR,qPCR)检测E2体注射后雌性金钱鱼下丘脑中相关基因的表达。[结果]雌性金钱鱼下丘脑转录组测序共测得Cleanreads为190909756,注释到17687个基因,筛选和鉴定了22个差异表达基因,包括prl、erf3α、pgr和cyp19a1b等11个表达上调基因和chsy1、muc17l、prf1和hla-α等11个下调基因。通过KEGG功能富集分析发现差异基因涉及13个代谢通路。转录组和qPCR结果显示,与对照雌鱼相比,E2注射组雌鱼下丘脑中prl、pgr、cyp