基于传统分离培养和高通量测序分析市售咸鳓鱼中微生物多样性
【摘要】 以6种浙东地区市售咸*鱼为对象，采用分离培养的方法结合16S.DNA24可变区高通量测序较为全面地探究其中微生物多样性，并且分析分离菌株氨基酸脱X酶基因及常见抗生素耐药基因携带情况。试验共分离获得151株可培养细菌，16SrDNA测序将其鉴定至14个属和23个种,其中芽V杆菌数量最多(98株,64.90%);葡萄球菌其次(20株，13.24%);嗜冷杆菌次之(13株861%)。132株分离菌株携带组氨酸脱X酶基因，占比高达%7.42%;鸟氨酸脱X酶基因和赖氨酸脱X酶基因的携带比例分别为46.36%和45.03%。耐药基因携带率处于较低水平。高通量测序研究结果表明，门水平上，厚壁菌门(Firmicutes)是市售咸*鱼中主要优势微生物。碱杆菌属(Alkalibacillus)-^慢性芽V杆菌属(Lentibacilus)狭义梭菌属(Clostrilumsensustricto')梭菌属(Clostr诚aceae)等分别在不同样品中占据较高比例，不同来源样品中微生物多样性呈现出较大的差异。
