甘薯基因组TCP转录因子鉴定与逆境胁迫表达分析
【摘要】 基于甘薯(Ipomoeabatatas(L.)Lam.)全基因组序列，利用生物信息学方法鉴定筛选了全基因组中的TCP(teosintebranched1/cincinnata/proliferatingcellfactor)转录因子，并分析了甘薯苗期在蔓割病菌胁迫及块根储藏期低温胁迫下TCP基因的表达差异。结果显示，甘薯基因组中共有27个TCP转录因子，其中ClassI13个、ClassII(CIN)8个、ClassII(CYC/TB1)6个。甘薯TCP以单个基因或基因簇的形式不均匀分布在15条染色体上，其中6对基因存在潜在复制关系。甘薯ClassI(CYC/TB1)转录因子含有R结构域，其氨基酸序列较为保守。在TCP家族中共发现10个保守基序(motif),基序的氨基酸序列长度为15-60个，其中motif1含有TCP结构域，motif3含有R结构域，TCP转录因子的保守基序种类在组间存在一定差异。逆境胁迫下甘薯的转录组数据分析结果表明，TCP转录因子在苗期受蔓割病侵染后有2个差异表达基因;在块根储
