基于高通量测序技术分析七种梨内生细菌多样性
【摘要】 目前对于梨内生细菌多样性的研究几乎为零，这在很大程度上限制了梨内生细菌资源的开发和利用. 为了探明梨内生细菌多样性，挖掘潜在的微生物资源及功能，研究采用高通量测序技术测定7个不同品种梨内生细菌菌群16S rRNA基因V4~V5区序列，并进行生物信息学分析. 在7个不同品种梨中获得有效序列数为30 001~42 255条，并聚成33~99个可操作分类单元（OTU），涉及17个门、28个纲、52个目、85个科以及120个属. 此外，7个梨品种内生细菌的Shannon指数、Simpson指数和Chao指数分别在0.481~1.154、0.452~0.730和42.333~103.875之间，说明测定的7个不同品种梨含有丰富的内生细菌种类，其中丰水梨和水晶梨内生细菌最为丰富. 不同分类阶元的统计结果表明，不同品种的梨在门、纲、目、科、属水平上的主要内生细菌类型相同，但具体占比不同. 7种梨内生细菌多样性均较为丰富，且不同梨品种菌群结构存在一定差异. 研究为进一步揭示梨与内生细菌
