绝经后骨质疏松症差异microRNA表达及靶基因分析
【摘要】 目的分析绝经后骨质疏松症(PMOP)女性外周血及骨组织中microRNA(miRNA)表达谱的变化，并对差异miRNA进行靶基因分析，为研究PMOP发病机制、筛选早期诊断标志物及骨质疏松性骨折的预防提供依据。方法获取公共数据平台NCBI-GEODataSets中的PMOPmiRNA研究数据:第一组为GSE64433数据集，包含23例PMOP患者及25例对照者的外周血样本miRNA表达谱;第二组为GSE74209数据集，包含6例PMOP患者及6例对照者的股骨颈骨组织样本miRNA表达谱。运用R/Bioconductor进行数据处理及差异miRNA分析，筛选每组中PMOP与对照者间表达倍数改变>2，P<0.05的miRNA为组间差异表达miRNA。结合TargetScan、miRDB、miRTarBase数据库进行miRNA靶基因预测，选取在三个数据库中均存在的靶基因，运用Cytoscape绘制并分析miRNA一靶基因调控网络图。结果在第一组中(GSE64433数据集)，PMOP外周血筛选出224个差异表达miRNA(75个上调miRNA，149个下调miRNA);在
