花生异型雄蕊转录组分析

【摘要】 以花生(4磁詆hypogaeaLinn.)品种'Florunner'为研究对象,利用RNA-seq技术对花生异型雄蕊进行转录组测序;在此基础上,运用Nr.KOG.GO和KEGG数据库进行同源序列比对和基因功能分析。结果显示:花生异型雄蕊转录组测序共获得数据量约31.46G,其中,cleanreads所占比例均在96.0%以上;经过组装和拼接后得到197193个contigs,片段总长度240463900bp,最长片段为15810bp,非冗余unigenes片段的平均长度为1219bp,GC含量为39.1%,片段长度N50为1966bp;长度大于等于1000bp的unigenes占unigenes总数的43.4%,表明组装完整性较高,可用于注释分析。与Nr数据库的比对结果显示:共有129223个unigenes注释到Nr数据库,占imigenes总数的65.5%;其中,1xIO-100