基于SRY基因分析梅花鹿的遗传多样性及父系类型

【摘要】 试验旨在研究梅花鹿基因的遗传多样性及其父系类型。选取东北亚种、北海道亚种、本州亚种、指名亚种、屋久岛亚种5个亚种的1**个个体,利用试剂盒和传统酚/仿(1:1)法进行DNA的提取,采用PCR扩增和直接测序法分析梅花鹿的核苷酸多样性(朽)、单倍型多样性()-)、遗传距离及系统进化关系。结果显示,试验所获序列长度为1613bp,在第*7、62、602、11*8、569、60*bp处共检测到6个SNPs多态位点,占核苷酸总数的0.3%,碱基替换以碱基转换为主%通过6个SNPs多态位点确立了6种单倍型:Hap-1、Hap-2、Hap-3、Hap-*、Hap-5和Hap-6,其中Hap-*、Hap-5和Hap-6为新发现单倍型。遗传多样性由高至低依次为:指名亚种、屋久岛亚种、东北亚种、本州亚种、北海道亚种。各亚种间遗传距离最小为北海道亚种与本州亚种的距离(0.000056),最大为东北亚种与指名亚种的距离(0.001733)。基于单倍型利用邻接法构建系统进化树,结果显示,与日本梅花鹿相比,东北亚种与马鹿关系更近,