水通道蛋白AQP1在圆锥角膜病变中的作用机制

【摘要】 汇编Proceedingsofthe7thSino-AmericanWorkshoponBiomedicalEngineeringandChina-OverseaJointWorkshoponBiomechanics771膜环境下肽链的粗粒化力场研究及开发陈淑文1,崔玉红1*,吕守芹2,潘君3,王天浩1天津大学;(1.2.中国科学院力学研究所;重庆大学)3.:E-mailyhcui@tju.edu.cn摘要:对于粗粒化力场的研究是考察生物大分子微观结构的动力学特征的重要基础,目前已开发的适用于生物体系的粗粒化力场精确度无法确定),开发在确定精确度下适用于膜环境中的肽链的粗粒化力场本文采用迭代玻尔兹曼反演法(。IBI。迭代玻尔兹曼反演法是一种基于分子结构确定势函数参数的方法,通过重现全原子结构动力学,模拟生成分子结构的各项分布函数,通过多次迭代计算,直到达到精确度要求,并同时确定力场参数。本文采用GROMACS方案对体系进行粗粒化体系的分布函数确定粗粒化体系的初始势能参数,并进行粗粒化模