糖尿病、冠状动脉疾病及两病并存患者基因表达差异分析
【摘要】 目的研究分析2型糖尿病(T2DM)、冠状动脉疾病(CAD)病理共有的关键调控基因及分子机制，并进一步分析上述2种疾病之间是否存在共有的调控基因，以期早诊断早干预。方法对确诊2型糖尿病、冠状动脉疾病、同患两病患者及正常对照组的外周血单核细胞进行转录组测序(RNA-sequencing)。利用基因本体论数据库(geneontology，GO)进行功能富集分析;京都基因和基因组百科全书数据库(KEGG)进行通路富集分析。然后应用生物通用交互数据集库(BioGRID，http://thebiogrid.org/)分析获得与冠状动脉疾病和(或)2型糖尿病的差异表达基因产物互作的蛋白质，并构建蛋白质-蛋白质互作关系网络，构建可视化网络。最后对基因表达数据库(GEO)中与2型糖尿病和冠状动脉疾病相关数据集，验证冠状动脉疾病和(或)2型糖尿病中的候选差异表达基因的表达水平。结果共计191个基因在2型糖尿病、冠状动脉疾病和两病共存条件下均差异表达;2型糖尿病特异性的蛋白质-蛋白质互作关系网络中，TCF4
