藜麦叶片响应低氮胁迫基因的可变剪接事件分析

【摘要】 缺氮环境对藜麦生长不利,为鉴定和分析藜麦响应低氮的可变剪接基因,采用1.42mmol·L-1)的藜麦叶片和对照组(氮浓度:)中68764两组处理的可变剪接事件均以第一个外显子可变剪切(个基因发生可变剪接事件26094CK。对比两组发生可变剪接的基因发现。功能富集分析表明,发生可变剪接的差异基因主要富集于代谢过程组中有1041TSSLN7.1mmol·L-1)藜麦叶片的转录组进行测序个,低氮处理组()中LN)和最后一个外显子可变剪切(。25562IlliminaHiseqTM分别对结个基因发生可变剪)个显著差异转移酶活性及水解刺激反应、、异源末端链接抗坏血酸和醛酸、、TTS147个新基因发生可变剪接,存在。KEGG通路分析表明,可变剪接差异基因显著富集到复制DNA错配修复系统等通路上,表明这些差异可变剪接基因参与了藜麦低氮胁迫的响应、